以往在各種媒體上對於內氣修煉過程中的感覺或體驗的論述已經非常多，而對於內氣修煉過程中的生理反應卻很少有論述。但人的感覺或體驗都是由人表述出來的，很難驗證其真實性和分辨其是幻覺還是實感。所以，可以被檢測到的生理反應才是判定一個人內氣修煉程度的最好依據。下面就按照在內氣修煉過程中出現的順序來說明內氣修煉過程中應該出現的一些生理反應。

1.肌肉跳動。——這種反應可以用手摸到，也可以觀察到。這種生理反應多發生於獲得氣感初期的練功過程中。其發生原因是，在獲得氣感初期，練功者的經絡不通暢、內氣波的頻率較低，因而導致內氣波的運行局限於一些局部。其最初發生的部位大多在臉部和手臂。而隨著練功的深入，發生部位會轉移到腿部和腳部，而且發生的次數和規模都會減少。

2.鎖骨窩內的脖筋抽動並突顯出來。——這種反應也可以摸到和看到。並且只是在獲得氣感的練功初期會發生這樣的反應。其發生機理與肌肉跳動的機理相同。

3.受過傷的皮膚出現角化及脫落。——這種生理反應都發生於獲得氣感後，內氣波的運行使得皮膚感到溫熱以後的階段內。其發生機理是，內氣波的運行引發了人體表面組織的結構重建。其意義是，在神經中樞的控制下，人體表面的一些錯誤結構得到修復。其對應的生理感覺是，角化及脫落處的皮膚感到癢、痛。

4.指甲縫內陷，指肚減小。——這種生理反應主要發生於手部氣感達到非常明顯的時候，是階段性的，也是可以明確觀察到的。一般在連續練功的進程中只會發生一次。其發生的機理是，當手部氣感很明顯時，內氣波的運行就會增強手指及指甲縫內的應力，從而導致手指及指甲縫內的組織結構重建。其對應的生理感覺是，手指及指甲縫感到疼痛、發脹。

5. 趾甲縫內陷，趾肚減小。——這種生理反應主要發生於腳部氣感達到非常明顯的時候，也是階段性的和可以明確觀察到的。一般在連續練功的進程中也只會發生一次。其發生的機理與對應的生理感覺都與指甲縫內陷，指肚減小的發生機理和對應的生理感覺是類似的，只不過這兩種反應發生的間隔時間往往比較長。

6.每天排便次數增加且排黑色的糞便，同時伴有持續的生理性低燒，如果嘔吐，則吐出的苦水也是黑色的。——這種生理反應發生於內氣波能夠在胃腸道內連續運行之後。其發生機理是，內氣波在胃腸道內的連續運行引發了胃腸道內壁的組織結構重建。其過程也是階段性的和可以明確觀察到的。但這樣的反應大多會在個人的練功進程中多次發生。其對應的生理感覺是，①胃部持續鈍痛，尤其是饑餓會加劇疼痛；②持續的全身乏力；③間斷性的噁心、眩暈。

7.鼻孔下端內壁腫脹並結痂脫落，同時鼻涕增多。——這種生理反應發生於內氣波能夠在口腔及鼻腔內連續運行之後，也是階段性的反應，一般在個人連續練功的進程中只會發生一次。其機理是，內氣波在鼻腔內的連續運行增強了鼻甲骨尖部周圍的內應力，並進而引發了鼻甲骨及鼻孔下端內壁的組織結構重建。其對應的生理感覺是，鼻孔下端內壁疼痛，鼻甲骨受到輕微擠壓也會感到疼痛。

8.畸形的肢體部分紅腫。——這類生理反應發生於內氣波能夠全身性地連續運行之後，也是階段性的和可以明確觀察到的，而且這類反應結束後，肢體的畸形都會得到很大程度的矯正。其發生機理是，內氣在全身性經脈中的連續運行啟動了生長控制中樞對肢體畸形的矯正過程，而這樣的過程也是部分肢體結構的組織重建過程。其反應對應的生理感覺是，紅腫的部分非常疼痛，其疼痛的程度有時可以達到難以忍受的程度。
在內氣的修煉過程中，會發生很多的生理反應，而以上八種生理反應是其中比較明顯的、不需要儀器就可以觀察到的，也是能夠代表內氣修煉階段的重要反應。同時以上八種生理反應也是所有氣功修煉者都應該經歷的過程，其中1—5種的順序也都是相同的。只不過對於不同的練功者來講，每種生理反應發生的時段、持續的時間和反應的強度都會有所差別，而且有的練功者由於內氣修煉不能夠加深而不會發生相應的生理反應。

在以上的論述中，多次提到“組織結構重建”的過程。而這樣的過程是在神經中樞的控制下進行的，是原有的一些組織細胞消亡而被分解或脫落的過程，也是一些組織細胞分裂而生成新的組織結構的過程