遊戲一開始，玩家需先選擇一個紀錄檔。這款遊戲是可以隨時存檔的喔！

為製造出快節奏的緊張氣氛，遊戲一開始省略掉了繁雜的劇情介紹，玩家會看見自己出現在一個簡樸的小屋，除了玩家，也就是米希亞戰紀一代的主角－米娜之外，還有老婆婆和村長，老婆婆會告知你村長來了，有重要的是要跟你說，跟村長對話後，了解到從村莊中的水源忽然消失了，玩家需接受任務到龍之谷探查究竟。

離開小屋後，往左北邊走，就可以到達龍之谷。

在龍之谷繼續往北邊走後，會發現被冰封起來的水源！立刻回到邊境村莊中，到東方的村長家跟村長報告。村長會請你去魔法戰士協會找傑伊。魔法戰士協會在村莊的西方，一個有瓦片的屋頂的建築。