1949年3月20日晚上9點15分左右，臺大法學院一年級學生何景岳和師範學院（今師大）博物系學生李元勳，共乘一輛腳踏車，經過大安橋附近時，被中山路（一說中正東路）員警謝延長以違反交通規則攔下，雙方發生衝突，兩名學生被毒打一頓，並於10點左右押往台北市第四警察分局（大安分局）拘押。之後學生包圍台北市警察局第四分局，並提出三點要求：局長出面賠禮道歉、處分打人的警察並保證不會再發生類似事件。次日，臺大與師院的學生便包圍台北市警察總局，沿路高唱中國大陸的學運歌曲《你是燈­塔》、《跌倒算什麼》，並且高呼中國大陸的學運口號：「­反內戰」、「反飢餓」、「反迫害」，引發政府的嚴重注意，以為校園受到中國共產黨的統戰與滲透。3月29日，臺大法學院舉辦營火晚會，會中高唱中國大陸解放區歌曲，消息傳到當時派任台灣的陳誠時，陳誠便決定鎮壓學生運動。

1949年4月6日，軍警便包圍台灣大學宿舍與師範大學宿舍進行逮捕行動，引發學生利用餐桌、椅擋住樓梯口，並且向軍警摔東西的反抗；最後軍警衝破包圍逮捕學生，並以卡車運走學生；其中師範大學治會主席周慎源雖然逃脫，但是據說不久後在清鄉中也遭到殺害。不少學生被捕後槍決，或是出走中國大陸。

之後除了部分涉入的學生遭到逮捕、槍決的命運，之後台灣省政府命令師範大學停課，所有學生一律重新登記，師範大學與台灣大學都被大力的「整頓」一番，校方實行軍事化的管理，校園戒嚴正式開始。一般認為，「四六事件」是台灣1950年代白色恐怖的濫觴。

台教會會長蔡丁貴說，台師大是負責教育中小學教師、校長的地方，也曾經發生「六四事件」，有學生被逮捕、迫害，他希望台師大能作示範，移除蔣中正銅像，伸張校園自由的意義。

郭義雄說，台師大校門口的蔣中正前總統銅像，是已逝的美術系教授闕明德，帶著美術系學生捏出來的，是一個藝術品，和其他的銅像不一樣，他希望「藝術品要用藝術的眼光來看」。