笨為早期農村儲榖之榖倉，以竹皮編成，上有木蓋或覆稻草，形如「古亭」（鼓燈），故稱古亭笨（鼓燈笨），笨港原是一個口岸，港邊有許多笨，故名笨港。

 第二說： 客家人說「補笨仔鯊」之港：

    笨仔港和永安漁港（崁頂厝）同為泉州人始拓，惟現居十之八九為客家人，客家人對地名起源另持一說：某年港邊湧入大批鯊魚，驅之不散，補之不竭，大獲魚利，因稱鯊魚為笨仔魚，捕魚之港為笨港。客家人所指的笨仔鯊乃學名紅肉雙絞的鯊魚，為本省共通性之魚產，腐食性或魚食性，常在河口棲息，淡水河口，社子溪口外海，就是此鯊魚之主要覓食區。紅肉雙髻鮫，製成魚漿，是做魚丸的好材料，早期是桃竹苗沿海重要魚產，近年來日漸稀少。

第三說： 「笨港」即「?港」： 

    此傳說和客家人所說雷同，指笨港為捕鯊之港，「?」、「笨」客家話發音相同，笨港即是?港。 

第四說：  笨港即畚港：

    一位居新豐之耆宿，告訴我說，笨港乃因港若畚箕形而得名，畚港笨港閩南語音相同，笨港即是畚港。